Given a dataset in long format, for instance generated by
msprep, this function takes a cross-section at a given time
point, to list the subjects under observation (at risk) at that time point
and the states currently occupied.
xsect(msdata, xtime = 0)
| msdata | An object of class |
|---|---|
| xtime | The time point at which the intersection is to be made |
A list containing idstate, a data frame containing
id's and state, the number of the state currently occupied;
atrisk, the number at risk, and prop, a table counting how
many of those at risk occupy which state.
It is possible that subjects have moved to one of the absorbing states prior
to xtime; this is NOT taken into account. The function xsect
only concerns subjects currently (at time) at risk.
Hein Putter H.Putter@lumc.nl
tmat <- trans.illdeath(names=c("Tx","PR","RelDeath")) data(ebmt3) # data from Section 4 of Putter, Fiocco & Geskus (2007) msebmt <- msprep(time=c(NA,"prtime","rfstime"),status=c(NA,"prstat","rfsstat"), data=ebmt3,trans=tmat) # At the start everyone is in state 1 (default xtime=0 is used) xsect(msebmt)#> id state #> 1 1 1 #> 2 2 1 #> 3 3 1 #> 4 4 1 #> 5 5 1 #> 6 6 1 #> 7 7 1 #> 8 8 1 #> 9 9 1 #> 10 10 1 #> 11 11 1 #> 12 12 1 #> 13 13 1 #> 14 14 1 #> 15 15 1 #> 16 16 1 #> 17 17 1 #> 18 18 1 #> 19 19 1 #> 20 20 1 #> 21 21 1 #> 22 22 1 #> 23 23 1 #> 24 24 1 #> 25 25 1 #> 26 26 1 #> 27 27 1 #> 28 28 1 #> 29 29 1 #> 30 30 1 #> 31 31 1 #> 32 32 1 #> 33 33 1 #> 34 34 1 #> 35 35 1 #> 36 36 1 #> 37 37 1 #> 38 38 1 #> 39 39 1 #> 40 40 1 #> 41 41 1 #> 42 42 1 #> 43 43 1 #> 44 44 1 #> 45 45 1 #> 46 46 1 #> 47 47 1 #> 48 48 1 #> 49 49 1 #> 50 50 1 #> 51 51 1 #> 52 52 1 #> 53 53 1 #> 54 54 1 #> 55 55 1 #> 56 56 1 #> 57 57 1 #> 58 58 1 #> 59 59 1 #> 60 60 1 #> 61 61 1 #> 62 62 1 #> 63 63 1 #> 64 64 1 #> 65 65 1 #> 66 66 1 #> 67 67 1 #> 68 68 1 #> 69 69 1 #> 70 70 1 #> 71 71 1 #> 72 72 1 #> 73 73 1 #> 74 74 1 #> 75 75 1 #> 76 76 1 #> 77 77 1 #> 78 78 1 #> 79 79 1 #> 80 80 1 #> 81 81 1 #> 82 82 1 #> 83 83 1 #> 84 84 1 #> 85 85 1 #> 86 86 1 #> 87 87 1 #> 88 88 1 #> 89 89 1 #> 90 90 1 #> 91 91 1 #> 92 92 1 #> 93 93 1 #> 94 94 1 #> 95 95 1 #> 96 96 1 #> 97 97 1 #> 98 98 1 #> 99 99 1 #> 100 100 1 #> 101 101 1 #> 102 102 1 #> 103 103 1 #> 104 104 1 #> 105 105 1 #> 106 106 1 #> 107 107 1 #> 108 108 1 #> 109 109 1 #> 110 110 1 #> 111 111 1 #> 112 112 1 #> 113 113 1 #> 114 114 1 #> 115 115 1 #> 116 116 1 #> 117 117 1 #> 118 118 1 #> 119 119 1 #> 120 120 1 #> 121 121 1 #> 122 122 1 #> 123 123 1 #> 124 124 1 #> 125 125 1 #> 126 126 1 #> 127 127 1 #> 128 128 1 #> 129 129 1 #> 130 130 1 #> 131 131 1 #> 132 132 1 #> 133 133 1 #> 134 134 1 #> 135 135 1 #> 136 136 1 #> 137 137 1 #> 138 138 1 #> 139 139 1 #> 140 140 1 #> 141 141 1 #> 142 142 1 #> 143 143 1 #> 144 144 1 #> 145 145 1 #> 146 146 1 #> 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224 224 1 #> 225 225 1 #> 226 226 1 #> 227 227 1 #> 228 228 1 #> 229 229 1 #> 230 230 1 #> 231 231 1 #> 232 232 1 #> 233 233 1 #> 234 234 1 #> 235 235 1 #> 236 236 1 #> 237 237 1 #> 238 238 1 #> 239 239 1 #> 240 240 1 #> 241 241 1 #> 242 242 1 #> 243 243 1 #> 244 244 1 #> 245 245 1 #> 246 246 1 #> 247 247 1 #> 248 248 1 #> 249 249 1 #> 250 250 1 #> 251 251 1 #> 252 252 1 #> 253 253 1 #> 254 254 1 #> 255 255 1 #> 256 256 1 #> 257 257 1 #> 258 258 1 #> 259 259 1 #> 260 260 1 #> 261 261 1 #> 262 262 1 #> 263 263 1 #> 264 264 1 #> 265 265 1 #> 266 266 1 #> 267 267 1 #> 268 268 1 #> 269 269 1 #> 270 270 1 #> 271 271 1 #> 272 272 1 #> 273 273 1 #> 274 274 1 #> 275 275 1 #> 276 276 1 #> 277 277 1 #> 278 278 1 #> 279 279 1 #> 280 280 1 #> 281 281 1 #> 282 282 1 #> 283 283 1 #> 284 284 1 #> 285 285 1 #> 286 286 1 #> 287 287 1 #> 288 288 1 #> 289 289 1 #> 290 290 1 #> 291 291 1 #> 292 292 1 #> 293 293 1 #> 294 294 1 #> 295 295 1 #> 296 296 1 #> 297 297 1 #> 298 298 1 #> 299 299 1 #> 300 300 1 #> 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