Given a dataset in long format, for instance generated by
msprep, this function takes a cross-section at a given time
point, to list the subjects under observation (at risk) at that time point
and the states currently occupied.
Arguments
- msdata
An object of class
"msdata", such as output bymsprep- xtime
The time point at which the intersection is to be made
Value
A list containing idstate, a data frame containing
id's and state, the number of the state currently occupied;
atrisk, the number at risk, and prop, a table counting how
many of those at risk occupy which state.
Details
It is possible that subjects have moved to one of the absorbing states prior
to xtime; this is NOT taken into account. The function xsect
only concerns subjects currently (at time) at risk.
Author
Hein Putter H.Putter@lumc.nl
Examples
tmat <- trans.illdeath(names=c("Tx","PR","RelDeath"))
data(ebmt3) # data from Section 4 of Putter, Fiocco & Geskus (2007)
msebmt <- msprep(time=c(NA,"prtime","rfstime"),status=c(NA,"prstat","rfsstat"),
data=ebmt3,trans=tmat)
# At the start everyone is in state 1 (default xtime=0 is used)
xsect(msebmt)
#> id state
#> 1 1 1
#> 2 2 1
#> 3 3 1
#> 4 4 1
#> 5 5 1
#> 6 6 1
#> 7 7 1
#> 8 8 1
#> 9 9 1
#> 10 10 1
#> 11 11 1
#> 12 12 1
#> 13 13 1
#> 14 14 1
#> 15 15 1
#> 16 16 1
#> 17 17 1
#> 18 18 1
#> 19 19 1
#> 20 20 1
#> 21 21 1
#> 22 22 1
#> 23 23 1
#> 24 24 1
#> 25 25 1
#> 26 26 1
#> 27 27 1
#> 28 28 1
#> 29 29 1
#> 30 30 1
#> 31 31 1
#> 32 32 1
#> 33 33 1
#> 34 34 1
#> 35 35 1
#> 36 36 1
#> 37 37 1
#> 38 38 1
#> 39 39 1
#> 40 40 1
#> 41 41 1
#> 42 42 1
#> 43 43 1
#> 44 44 1
#> 45 45 1
#> 46 46 1
#> 47 47 1
#> 48 48 1
#> 49 49 1
#> 50 50 1
#> 51 51 1
#> 52 52 1
#> 53 53 1
#> 54 54 1
#> 55 55 1
#> 56 56 1
#> 57 57 1
#> 58 58 1
#> 59 59 1
#> 60 60 1
#> 61 61 1
#> 62 62 1
#> 63 63 1
#> 64 64 1
#> 65 65 1
#> 66 66 1
#> 67 67 1
#> 68 68 1
#> 69 69 1
#> 70 70 1
#> 71 71 1
#> 72 72 1
#> 73 73 1
#> 74 74 1
#> 75 75 1
#> 76 76 1
#> 77 77 1
#> 78 78 1
#> 79 79 1
#> 80 80 1
#> 81 81 1
#> 82 82 1
#> 83 83 1
#> 84 84 1
#> 85 85 1
#> 86 86 1
#> 87 87 1
#> 88 88 1
#> 89 89 1
#> 90 90 1
#> 91 91 1
#> 92 92 1
#> 93 93 1
#> 94 94 1
#> 95 95 1
#> 96 96 1
#> 97 97 1
#> 98 98 1
#> 99 99 1
#> 100 100 1
#> 101 101 1
#> 102 102 1
#> 103 103 1
#> 104 104 1
#> 105 105 1
#> 106 106 1
#> 107 107 1
#> 108 108 1
#> 109 109 1
#> 110 110 1
#> 111 111 1
#> 112 112 1
#> 113 113 1
#> 114 114 1
#> 115 115 1
#> 116 116 1
#> 117 117 1
#> 118 118 1
#> 119 119 1
#> 120 120 1
#> 121 121 1
#> 122 122 1
#> 123 123 1
#> 124 124 1
#> 125 125 1
#> 126 126 1
#> 127 127 1
#> 128 128 1
#> 129 129 1
#> 130 130 1
#> 131 131 1
#> 132 132 1
#> 133 133 1
#> 134 134 1
#> 135 135 1
#> 136 136 1
#> 137 137 1
#> 138 138 1
#> 139 139 1
#> 140 140 1
#> 141 141 1
#> 142 142 1
#> 143 143 1
#> 144 144 1
#> 145 145 1
#> 146 146 1
#> 147 147 1
#> 148 148 1
#> 149 149 1
#> 150 150 1
#> 151 151 1
#> 152 152 1
#> 153 153 1
#> 154 154 1
#> 155 155 1
#> 156 156 1
#> 157 157 1
#> 158 158 1
#> 159 159 1
#> 160 160 1
#> 161 161 1
#> 162 162 1
#> 163 163 1
#> 164 164 1
#> 165 165 1
#> 166 166 1
#> 167 167 1
#> 168 168 1
#> 169 169 1
#> 170 170 1
#> 171 171 1
#> 172 172 1
#> 173 173 1
#> 174 174 1
#> 175 175 1
#> 176 176 1
#> 177 177 1
#> 178 178 1
#> 179 179 1
#> 180 180 1
#> 181 181 1
#> 182 182 1
#> 183 183 1
#> 184 184 1
#> 185 185 1
#> 186 186 1
#> 187 187 1
#> 188 188 1
#> 189 189 1
#> 190 190 1
#> 191 191 1
#> 192 192 1
#> 193 193 1
#> 194 194 1
#> 195 195 1
#> 196 196 1
#> 197 197 1
#> 198 198 1
#> 199 199 1
#> 200 200 1
#> 201 201 1
#> 202 202 1
#> 203 203 1
#> 204 204 1
#> 205 205 1
#> 206 206 1
#> 207 207 1
#> 208 208 1
#> 209 209 1
#> 210 210 1
#> 211 211 1
#> 212 212 1
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#> 214 214 1
#> 215 215 1
#> 216 216 1
#> 217 217 1
#> 218 218 1
#> 219 219 1
#> 220 220 1
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#> 223 223 1
#> 224 224 1
#> 225 225 1
#> 226 226 1
#> 227 227 1
#> 228 228 1
#> 229 229 1
#> 230 230 1
#> 231 231 1
#> 232 232 1
#> 233 233 1
#> 234 234 1
#> 235 235 1
#> 236 236 1
#> 237 237 1
#> 238 238 1
#> 239 239 1
#> 240 240 1
#> 241 241 1
#> 242 242 1
#> 243 243 1
#> 244 244 1
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#> 246 246 1
#> 247 247 1
#> 248 248 1
#> 249 249 1
#> 250 250 1
#> 251 251 1
#> 252 252 1
#> 253 253 1
#> 254 254 1
#> 255 255 1
#> 256 256 1
#> 257 257 1
#> 258 258 1
#> 259 259 1
#> 260 260 1
#> 261 261 1
#> 262 262 1
#> 263 263 1
#> 264 264 1
#> 265 265 1
#> 266 266 1
#> 267 267 1
#> 268 268 1
#> 269 269 1
#> 270 270 1
#> 271 271 1
#> 272 272 1
#> 273 273 1
#> 274 274 1
#> 275 275 1
#> 276 276 1
#> 277 277 1
#> 278 278 1
#> 279 279 1
#> 280 280 1
#> 281 281 1
#> 282 282 1
#> 283 283 1
#> 284 284 1
#> 285 285 1
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#> 288 288 1
#> 289 289 1
#> 290 290 1
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#> 294 294 1
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#> 298 298 1
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#> 309 309 1
#> 310 310 1
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#> 313 313 1
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#> 319 319 1
#> 320 320 1
#> 321 321 1
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#> 323 323 1
#> 324 324 1
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#> 328 328 1
#> 329 329 1
#> 330 330 1
#> 331 331 1
#> 332 332 1
#> 333 333 1
#> 334 334 1
#> 335 335 1
#> 336 336 1
#> 337 337 1
#> 338 338 1
#> 339 339 1
#> 340 340 1
#> 341 341 1
#> 342 342 1
#> 343 343 1
#> 344 344 1
#> 345 345 1
#> 346 346 1
#> 347 347 1
#> 348 348 1
#> 349 349 1
#> 350 350 1
#> 351 351 1
#> 352 352 1
#> 353 353 1
#> 354 354 1
#> 355 355 1
#> 356 356 1
#> 357 357 1
#> 358 358 1
#> 359 359 1
#> 360 360 1
#> 361 361 1
#> 362 362 1
#> 363 363 1
#> 364 364 1
#> 365 365 1
#> 366 366 1
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#> 368 368 1
#> 369 369 1
#> 370 370 1
#> 371 371 1
#> 372 372 1
#> 373 373 1
#> 374 374 1
#> 375 375 1
#> 376 376 1
#> 377 377 1
#> 378 378 1
#> 379 379 1
#> 380 380 1
#> 381 381 1
#> 382 382 1
#> 383 383 1
#> 384 384 1
#> 385 385 1
#> 386 386 1
#> 387 387 1
#> 388 388 1
#> 389 389 1
#> 390 390 1
#> 391 391 1
#> 392 392 1
#> 393 393 1
#> 394 394 1
#> 395 395 1
#> 396 396 1
#> 397 397 1
#> 398 398 1
#> 399 399 1
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#> 429 429 1
#> 430 430 1
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#> 433 433 1
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#> 439 439 1
#> 440 440 1
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#> 442 442 1
#> 443 443 1
#> 444 444 1
#> 445 445 1
#> 446 446 1
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#> 448 448 1
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#> 450 450 1
#> 451 451 1
#> 452 452 1
#> 453 453 1
#> 454 454 1
#> 455 455 1
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#> 457 457 1
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#> 462 462 1
#> 463 463 1
#> 464 464 1
#> 465 465 1
#> 466 466 1
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